TOP > 巻一覧 > 目次一覧 > 書誌事項 > 引用文献一覧


バイオインフォマティクス推進センター事業(BIRD) 第8回研究開発成果報告会 知識発見への挑戦 〜バイオインフォマティクスの飛躍に向けて〜 要旨集  4-9
メタゲノム統合解析システムの開発
黒川 顕


[1] 森宙史, 丸山史人, 黒川 顕 メタゲノムインフォマティクス, 難培養微生物研究の最新技術II, pp82-91, (2010) シーエムシー出版, 東京
[2] Kuwahara T., Ogura Y., Oshima K., Kurokawa K., Ooka T., Hirakawa H., Itoh T., Nakayama-Imaohji H., Ichimura M., Itoh K., Ishifune C., Maekawa Y., Yasutomo K., Hattori M., Hayashi T. The Lifestyle of the Segmented Filamentous Bacterium: A Non-Culturable Gut-Associated Immunostimulating Microbe Inferred by Whole-Genome Sequencing. DNA Res., Jul 26, (2011) Epub.
[3] Mori H., Maruyama F., Kurokawa K. VITCOMIC: visualization tool for taxonomic compositions of microbial communities based on 16S rRNA gene sequences., BMC Bioinfo., 11: 332, (2010).
[4] 森宙史, 丸山史人, 黒川 顕 メタゲノムデータベース, メタゲノム解析技術の最前線, pp42-53, (2010).シーエムシー出版, 東京
[5] Masahira H., Oshima K., Kim S., Kurokawa K., Toh H., Taylor T.. Metagenomics and genomics decoding human gut microbiome, Genes Genet. Syst., 84: 479-479, (2009).
[6] Kurokawa K., Itoh T., Kuwahara T., Oshima K., Toh H., Toyoda A., Takami H., Morita H., Sharma V.K., Srivastava T.P., Taylor T., Noguchi H., Mori H., Ogura Y., Ehrich D.S., Itoh K., Takagi T., Sakaki Y., Hayashi T., Hattori M.. (2007) Comparative metagenomics revealed commonly enriched gene sets in human gut microbiomes. DNA Res., 14: 169-181, (2007).
[7] Arumugam M., Raes J., Pelletier E. Paslier D.L., Yamada T., Mendel D. R., Fernandes G.R., Tap J., Bruls T. Batto J.M., Bertalan M., Borruel N., Casellas F., Fernandez L., Gautier L., Hansen T., Hattori M., Hayashi T., Kleerebezem M., Kurokawa K., Leclerc M., Levenez F., Manichanh C., Nielsen H.B., Nielsen T., Pons N., Poulain J., Qin J., Sicheritz-Ponten T., Tims S., Torrents D., Ugarte E., Zoetendal E.G., Wang J., Guarner F., Pedersen O., de Vos W.M., Brunak S., Doré J., MetaHIT Consortium, Weissenbach J., Ehrlich S.D., Bork P. Enterotypes of the human gut microbiome. Nature, 473: 174-180, (2011).